قامت إدارة المعهد بإحداث الكراسي العلمية الوعظية داخل فضاء مسجد الإمام نافع بتنسيق مع المجلس العلمي المحلي لعمالة طنجة أصيلا والمندوبية الجهوية للشؤون الإسلامية لجهة طنجة تطوان الحسيمة.
يحضرها تلاميذ وطلاب وطالبات المعهد إضافة إلى عموم الناس إحياء لما جرى عليه العمل بمساجد المملكة المغربية الشريفة عبر تاريخها الطويل الحافل بخدمة العلم ونشر المعرفة بين أبناء المجتمع من خلال الدروس التي كانت تقدم ببيوت الله تعالى وتجاوبا مع المبادرة الملكية السامية بإعادة تفعيل دور المساجد في نشر العلم والقيم والأخلاق من خلال برنامج محو الأمية بالمساجد وغيره من المبادرات المتصلة بهذا المجال.
وقد اختارت إدارة المعهد نخبة من العلماء والأساتذة المعروفين بكفاءتهم العلمية والتربوية والخلقية للقيام بهذه المهمة النبيلة وفق البرنامج الآتي: